Hola, vayamos por partes. Primero te tiene que reconocer el mando, si conectas el gamepad y al accionar la cruceta no ves movimiento en la pantalla es que no lo detecta. Si no lo detecta, necesitaras hacerte root y cargar el modulo correspondiente en el kernel.
Si en caso contrario, SI que hay movimiento al accionar la cruceta entonces la cosa es tan simple como ir al emulador y en sus opciones cambiar las teclas por pulsaciones del mando.
Salu2