Creo que faltaria hacer un mount rw de la carpeta system en el proceso justo antes de que empiece a eliminar apk. Algo asi (la linea verde):
...
:EH27LIMPIADOR
cls
.\bin\adb shell "su -c 'mount -o remount rw /system'"
for /f "skip=2 tokens=1-7 delims=#" %%a in (.\%EH27FICHERO1%)do (
...
Y cuando finaliza el proceso volver a montarlo como lectura:
:EH27vuelvevalora
echo.
)
.\bin\adb shell "su -c 'mount -o remount ro /system'"
echo.********************************************* ********************************
echo.Proceso finalizado
Esperar a que elhechicero confirme si esto seria correcto, o no lo ha puesto por algún motivo.
Un saludo