La localización que se desactiva desde los ajustes de la aplicación creo que es para no mostrar tu ubicación cuando estás en el chat de Facebook. Pero desde Diciembre la aplicación es nativa en android, requería más permisos y creo recordar que uno de ellos era la ubicación GPS. Para evitarlo puedes ir a ajustes y desactivar la localización, no se exáctamente en la ROM stock donde es porque tengo la CM10. Al postear fíjate que no esté marcado el símbolo de posicionamiento, el segundo icono de abajo.
Una solución es alguna apk que modifique los permisos de la aplicaciones, necesario ser root.