Bueno os cuento mi experiencia de un caso parecido... Cuando estaba actualizándose mi Note a la 4.0.3 allá por el mes de mayo del año pasado, en un momento dado se quedó sin batería y claro, sin el cargador a mano, ya que estaba en el trabajo...
El móvil muerto y sin dar señales de vida, acojonado, al volver a casa lo conecté al cargador y ¡voila! el sólo retomó la actualización y sin problemas, pero menudo susto...
Desconozco en qué fase de la actualización estaba cuando se agotó la batería pero el caso es que finalmente no pasó nada...