Si vas a restaurar la rom anterior con el nandroid backup te restaura rom + aplicacipnes + configuracion.
Si es para ir probando roms pues con el backup pro, aunque bno es muy aconsejable ya que suele dar fcs.
Si son las rom de superatmel puedes hacerlo con el supsetup.
Saludos!
PD: Supongo que lo que tu querias era algo como el sdconfig para wm, que lo instalaba todo automaticamente... creo que de momento no existe... que me corrijan los savios