No soy un gran experto, pero por lo que se si sobrecargas el teléfono el arranque será más lento, lo de pasar las APP a la SD, es una buena opción en el caso de aplicaciones que no use el terminal nada más encenderse, por ejemplo un launcher será aconsejable tenerlo en la interna, pero un juego o música, si que yo las pasaría a la SD.
Si estoy equivocado en algo que me corrijan , solo intento aportar hasta donde llegan mis conocimientos ^^