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Si eres root puedes probar Autokiller Memory Optimizer, que puedes descargar aquí --> http://www.htcmania.com/showthread.php?t=287132. Tiene algunos Tweaks avanzados que a mí particularmente me han ido bien.

Con el Titanium Backup (http://www.htcmania.com/showthread.php?t=389597) o el Root Uninstaller (http://www.htcmania.com/showthread.php?t=303871), más que borrarlas lo que yo hago es congelarlas (freeze), por seguridad y por lo que pudiera pasar. Yo he congelado el Google Maps, por ejemplo, o el Facebook, Twitter, Timescape y un gran número de aplicaciones de sistema que he visto que son seguras de desactivar y me aseguro de que no trabajen en segundo plano.

Saludos.