Eso mismo me paso a mi ayer , te resumo mi caso a ver si das con la tecla.
En el ordenador del curro la ultima version de flashtools me daba ese error, pero en cambio en el ordenador de casa con la version anterior, me funciono a la perfeccion. En el post que abri me comentaron algo de drivers,
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=525680
Leete lo que me pone Kastell de los drivers a ver si te puede servir y ya me dices.