Al final la he restaurado y estoy instalándolo todo para dejarla igual. Esta vez para rootear , en lugar del Nexus Root Toolkit, he usado el Nexus 7 Toolkit v4.0.0 , y se ve que lo hace mejor, porque antes tenía problemas con alguna app como rom manager y ahora no. Resumiendo: restauré de fábrica (fastboot -w update), vuelvo a tener 4.2.1, rooteado con toolkit 4.0.0, con multirom instalado también (y su recovery adaptado), y... ya no tengo el fallo, basta con pulsar 2-3 seg. Me queda aún volver a dejarlo todo como estaba, ya avisaré si me vuelve a aparecer el problema. Resaltar eso, que sospecho que tenga algo que ver el root toolkit
En cuanto a la cámara tenías razón, no se cuando ni donde la instalé, pero al restaurar me pedía instalar una camara de modaco y lo he cancelado.