Pues lo primero antes de nada, es hacer un backup al menos de lo que tienes en la partición vfat (donde están las fotos y las demás cosillas), enchufandola al ordenador y copiando su contenido tal cual.
Luego desde el recovery puedes reestructurar la SD con la opción Partition sdcard y o rehaces todas las particiones o las que te interesen. El App2SD se activa solo a la que detecta la partición