Lo de los wipes dependerá de si necesitas hacer una restauración completa de fábrica o no o borrar la Dalvik caché. Y a su vez, depende de la ROM origen y destino, pero para el proceso de flashear no influye.
Por si tienes dudas sobre el EMMC-bug que lleva al brick fatal, se supone que Mobile Odin usa un método seguro, pero te aconsejo que tomes las precauciones necesarias.