Por ejemplo, hay launchers que tienen opciones para añadir acciones cuando haces algunos gestos, otros que te permiten hacer carpetas en la lista de aplicaciones, otros que intentan parecerse lo más posible al Android sin personalizaciones... Si no quieres meter roms la opción más sencilla de personalizar es instalar un launcher.
A mí me gusta el Apex, es muy parecido al Android de los Nexus, pero con añadidos. Lo tengo en mi S2 desde hace tiempo, independientemente de la rom.