Hombre, parece ser que los archivos estaban en formatos diferentes, así que con mis conocimientos, no se si puedes hacer lo que quieres.
Igual algún compi te puede echar una mano, pero vamos, lo veo complicado.
Si lo tuvieras todo en el mismo formato de archivo, lo suyo sería volver a dejar la Rom como la tenías, incluído el mismo kernel, ok? y una vez tuvieras Rom + kernel, supongo que no habría más problema para restaurar el nandroid, pero ya te digo que si unos archivos están en ext4 y los otros ni se sabe, pueeeeees, ya te digo que por lo menos yo, no puedo ayudarte porque no doy más de mi.
Suerte.
Taluego!!