ahora no recuerdo porque eso lo probé hace más de un mes. lo que puedes hacer es un backup antes de nada, pruebas el mod que quieres poner y si te gusta, va bien, etc queda puesto y si no te gusta o fallan otras aplicaciones o surge algún problema restauras el backup.
las stock rom de ics son odexed por defecto, si mal no recuerdo podrás ver los archivos .odex en la carpeta /data o en system/app. si metes el deodexed script lo que pasará es que desaparecerán esos archivos .odex pero aumentarán de tamaño otros relacionados con la aplicación, normalmente con extensión .dex
te dejo un link (en inglés) donde explica la diferencia y el porqué hay deodexed roms, se entiende bastante bien; echa un ojo a la parte final
http://www.talkandroid.com/guides/mi...e-explanation