Vaya, pues no hay nada que hacer entonces... espero que lo solucionen en la 2.0 porque me parece un fallo bastante gordo.
Usé el Mybackup para restaurar además todos los datos del sistema salvo los contactos y fue todo más o menos bien. Te restaura las configuraciones del sistema, los iconos de los escritorios (pero los widgets dan error y hay que volver a ponerlos). Lo único que tampoco guarda son las preferencias de los programas. Los sms se hicieron un poco de lío con las fechas y tuve que hacer una ñapa para que volvieran a las fechas originales.
Vamos, que un wipe lleva más trabajo del que se piensa en un principio. Supongo que siendo root a lo mejor hay algún programa mejor para estas cosas.