Hola,
LA verdad no entiendo como se le van a desaparecer los programas que ya tenia.
Yo lo he instalado miles de veces al cambiar de ROM y no me pasa nada de eso.
Dile que lo desinstale para ver si le aparecen los programas que se le perdieron.
Y luego que lo vuelva a instalar para probar si vuelve a pasar.
Un Saludo