Si tienes una tarjeta de 4gb y después de todo el proceso solo tienes disponibles 3.5gb (aprox) en FAT32 todo apunta a que funciona. Tambien puedes descargarte un explorador de archivos con permisos de root (SU File manager, root explorer,...) y buscar la carpeta /system/sd/, si dentro tienes las carpetas /apps y /apps-private con aplicaciones dentro es que funciona. O puedes hacerlo desde el ordenador con adb shell y hacer un ls /system/sd/app.
La memoria interna disponible es para la carpeta /data y sigue disminuyendo porque cada app genera unos archivos de configuración y cache dentro de ella.
Cerrar los programas no suele ser una opción. Android los deja "en espera" en segundo plano y cuando necesita memoria las va cerrando sin problemas, no te preocupes por eso. Si quieres forzar algún cierre hay cientos de aplicaciones para eso (task killers, task managers...)
Por cierto, si mantienes pulsado HOME verás las últimas seis aplicaciones ejecutadas, no las que están en segundo plano.