Aunque este basada una ROM en otra puede llevar muchos cambios internos en el famework o libreias y mas cuando hablas de una MIUI que cambia muchas cosas a la base para tener el aspecto y funciones tipicas de este tipo de ROM.
Para no llevarte una desilusion con bug o mal rendimiento, calentamientos excesivos, etc... lo mejor es instalacion limpia si o si y quitarte de problemas.
Al fin y al cabo al ser totalmente distintas las configuraciones de CM pura no te sirven de mucho (o para nada) y las app... bendito titanium backup o similares que en pocos minutos las tienes configuradas (ojo con esto tienes que saber bien las que restauras los datos por si llevan algun cambio que te la lia)