Hola, te intento contestar aunque si me meto la pata que me corrijan :-P
1. Las aplicaciones se instalan en la memoria del teléfono por defecto a no ser que hagas al A2SD a la microSD para poder instalarlas en la SD, realmente no debería influir el tener mas aplicaciones o no instaladas, eso si mientras no llenes toda la memoria, lo que influye es el número de aplicaciones que corres a la vez y chupan CPU y mem del sistema.
2. Para instalar en la SD, como te comentaba antes tiene que ser con una ROM modificada como las de Modaco y haciendole el A2SD a la microSD, para esto te invito a usar el buscador o bien mirar en los post con chinchetas del apartado "ROMs HTC Hero" donde hay varios tutoriales muy explicativos.
3. Para desinstalar programas en Configuración->Aplicaciones->Administración de aplicaciones tienes la opción de desinstalarlas, en un principio no debería de dejarse basura.
Salu2