A veces me ha pasado a mi que al reiniciar el teléfono en modo Recovery no monta la SD Externa, únicamente la interna.
Reiniciando el teléfono suele funcionar.
Otra cosa que puedes probar es reiniciar en modo Recovery y hacer esto:
- Mount and Storage --> Mount USB Storage
Haciendo esto, te monta la SD Externa y des del PC puedes entrar, copiar, borrar, etc. en la SD Externa.
Yo lo hago mucho cuando me olvido de copiar algún mod y solo he copiado la ROM jeje
NOTA: No salgas de Mount USB Storage porque sino te "desmonta" automáticamente la SD Externa.