Con el rootexplorer, quitando de la carpeta /system/app todas las que no quieras. Depende del gusto, se copian en una carpeta en tu SD (por si las moscas) o simplemente las borras
Otra opción es el SolidExplorer, muy fluido y conexiones FTP y SSH, conexión a Dropbox, dos paneles... y es gratuito, pero pesa MUCHO más que el rootexplorer.
Un saludo!