Hola compi,
Si NO me equivoco, cuando vas a restaurar un backup con el nandroid, el te pone que busca la ultima actualizacion y te la instala. Yo tengo 5 backups y segun me interese una u otra quito las restantes moviendolas a otra carpeta, asi solo me recupera la que yo quiero. Yo nunca hice wipe ya que entiendo que pisa todo todo todo.
Saludos.