La sd interna si la formatea, te lo aseguro

Pero al no formatear /data tendrás la configuración que tenías antes, con los accesos directos y todo cómo lo tenías, pero lo que tuvieses en /sdcard te lo liquida. Haz un respaldo con titanium que no se tarda nada y vuelcalo al PC porque si flasheas te lo va a borrar,luego reinstalas titanium y lo vuelves a colocar en /sdcard y restauras, así te ahorras sustos y ya lo tienes para futuras actualizaciones. Un saludo.