La verdad, no soy un experto pero las funciones 2 y 3 las puedes hacer perfectamente con el S-pen, puedes pegar la foto en una nota y escribir o pegar lo que quieras. También tiene reconocimiento de escritura manual, así que puedes usar el programa que prefieras para tomar apuntes.
En la función 1 se me ocurre que en el pdf también puedes recortar la parte que quieras, pegarla donde quieras y añadir comentarios encima.
A ver si alguien con algo más de idea aporta más información y aprendemos todos.