Lo he solucionado (creo) pasando mediante root explorer la carpeta rerware (que estaba en la tarjeta externa) a la ruta indicada /mnt/sdcard/external_sd (que aunque parezca lo contrario está en la tarjeta interna).
Por si a alguien le sirve lo comento. Tengo un SGS II y me ha ocurrido al hacer el backup para poner cyanogenmod10.