Van con el instalador aroma, que no es más que un asistente para elegir lo que quieres instalar y lo que no. También puedes elegir que wipes hacer, si quieres cambiar el kernel, 3 temas para theme chooser, Apex y/o Nova, etc...
Por eso digo que es conveniente instalar solo las inverted gapps. A mi la primera vez que las puse con cm10 se me ocurrió instalar el apex desde ahí y al actualizar a la siguiente nightly se perdió, y tuve que instalar el del gplay y volverlo a configurar. Y desde entonces solo meto las inverted