Pues que raro algo harás mal, yo tengo la JB stock rooteada y me va bien, te lo voy a poner por pasos por si te has dejado algo o no se...
1) Con, por ejemplo, root explorer copias la apk del tiempo y la pegas en la carpeta system/app
2) Cambias los permisos a R,W-R-R
3) Reinicias el móvil
Vamos es lo que se suele hacer con todas las apk, nada raro, no sé los conocimientos que tendrás sobre esto, quizá te parezca la explicación una gilipollez pero bueno por si acaso =)
