Pues si te sucedió eso es que instalaste la versión con CWM inyectado, es decir, la preparada para ser ROOT.
SmartFlash tool formatea el teléfono una vez instalada la ROM, pero al inyectarle CWM en lugar de formatearlo arranca directamente en este, con lo cual te actualiza el teléfono en lugar de limpiarlo por completo.
Si no fuese mucha molestia podrías asegurarte de que descargaste la versión correcta?... es para no tener que chequear los enlaces.
