EXITAZO!
He cogido el APK del reloj del tema AlienAqua (AlarmClock.apk) y he modificado los PNGs como a mí me gustaban (están dentro del APK -es un zip- en la carpeta res/drawable). Luego he firmado el APK con el autosign.
Después he abierto el fichero ZIP del tema que me gustaba (el original del CyanogenMod Superatmelizado), y he cambiado el AlarmClock.apk que había con el nuevo que yo he creado. Y también he firmado este ZIP con el autosign.
Finalmente, he metido el ZIP en la SD, recovery, instalar y tacháááááán: ya tengo el reloj que quería!!!!
Gracias, Joshuas!