Yo diría que al formatear desde el propio terminal no crea ningún tipo de carpeta, las aplicaciones, como por ejemplo la de fotografiar, van creando las carpetas a medida que las necesita (de ahí a que te haya creado la carpeta DCIM y dentro de ella Camera y 100ANDRO)
Puedes crear las carpetas como quieras, el sistema ya se encargará de organizar la galería y el reproductor. Puedes crear por ejemplo una carpeta que se llame Fondos y ahí meter tus fondos de pantalla, y otra que se llame Fotos otro móvil, y copiar fotos de tu antiguo móvil, por ejemplo. Después en la Galería te aparecerá la carpeta de "Todas las imágenes", la carpeta de "Imágenes de la cámara", otra con nombre "Fondos" y otra con nombre "Fotos otro móvil". Para los archivos de música sucede lo mismo puedes crear tantas carpetas como quieras, con el nombre que quieras, que mientras el formato sea reconocido por el sistema, te aparecerán el reproductor.
Luego viene la otra opción que quizás quieras que algunos archivos multimedia (fotos, audio y vídeos) NO aparezcan en la galería de tu móvil, entonces dentro de esa carpeta tienes que crear un archivo en blanco con el nombre ".nomedia" (empezando con un punto y sin las comillas)
Espero que te sirva de ayuda!