Puede ser que sea por el launcher que tienes al apex launcher???
Yo tengo el oficial de Ics con la rom movistar tuneada y chapuza realizada y no me sale así.
Prueba a desconectar el apex launcher y si quieres un launcher parecido pero extraído directamente,pásate por el hilo de mod xperia u y lo podrás poner como esta en la foto de allí por eso yo te preguntaba lo de los iconos porque en el de google aún no los e cambiado xd.
PD: sobre la notificación del teclado es totalmente normal supongo que no has desinstalado el teclado japones e chino del xperia no?