Hola,
No soy muy experto, pero hay buenos tutoriales para flashear, en la seccion de roms lo encontraras. No puedo ponerte el link porque al ser de los que leen y no publican.... tengo menos de dos posts y hay una medida antispam del foro que no me lo permite.
Y por lo que tengo entendido, si la room que pones nueva no viene rooteada, tu movil dejara de estar rooteado. Asi que una vez pongas la original no hay que preocuparse por el rooteo si tienes que mandarlo al SAT.