Segun mis conocimientos, lo peor es descargar la batería (se puede dañar)
Así que optaría por el primer método:
1 Cargas al 100%
2 Desconectas el cargador
3 Vuelves a conectarlo, y entonces:
3.1 El led sigue verde->Wipe battery y ya estaría calibrada.
3.2 Cargas hasta el 100% de nuevo y vuelves al paso 2