Sólo se me ocurre que no tengas bien las particiones de sistema
Métete en el recovery y dime qué te muestra exactamente en el menú info, dime qué te indica en system, data, cache, sd-card, sd-ext y swap y en qué orden te aparece (es importante que las tengas en el orden que te he puesto)
Y otra cosa ¿La ROM la instalas copiándola a la SD y luego eliges la opción del recovery "install from sdcard"?
