Para recuperar las aplicaciones cuando lo desees o te sea necesario ve arriba a la derecha hay un icono que es como una hoja con una V. Pinchas en el y vas :
'Restaurar / Restaurar las aplicaciones que faltan con sus datos'
Abras el recovery con el X-Parts o lo hagas manualmente tienes que reiniciar desde la opción del recovery 'Reboot System Now' para que reinicie el móvil bien ya que para entrar al recovery el móvil lo que hace es apagarse y entra en el recovery antes de encenderse.
Algo así como cuando se entra a MS-Dos en el PC sin entrar en Windows. No se si me explico.
