Aja...te reparará el sistema en cuanto a permisos, pero te advierto que posiblemente algunas apps que ahora tienes "sin errores" pero realmente "no estan bien" cantarán. Mi reparador permite gracias a la reparación de permisos, que lo que está mal , cante error. Por lo tanto....si X apps te dan error tras reparar sistema, desinstálalas, instálalas de nuevo y ten por seguro que el sistema estará 99% reparado. Y pongo un 1% menos porque a veces hay bugs que son problema directo de las propias apps y no tiene nada que ver. Asi que no te asustes si ahora no tienes FCs y luego si. Ahora no los tienes, pero porque esas apps "NO FUNCIONAN" o cuando lo intentan "petan el sistema sin avisos". Luego funcionarán y darán el error. Por lo tanto las identificas y reparas, bien mediante desinstalar/reiniciar/ instalar o bien metiendolas a pelo de nuevo por ADB si son servicios del /system/app o similar.
Suerte.