En la actualización previa a Jelly Bean se actualizaba la camara, gps, etc... ¿quizas tambien se actualizaba el control tactil?. Podria ser eso lo que no se instalo bien y ahora JB lo requiere, te lo pide cada vez que inicias y lo actualiza pero no queda correctamente registrado.
Por supuesto todo esto son conjeturas...

