Sí, es perfectamente posible configurar varios APN y elegir el que interese en cada momento.
Debes ir a Ajustes -> Conexiones inalámbricas -> Redes móviles -> APN
Desde ahí puedes configurar nuevos APN y activar el que necesites.
Como curiosidad, la Magic almacena los APN en función de la SIM que esté insertada en cada momento. Si por ejemplo pones una SIM de Yoigo y configuras tres APN, cuando cambies de SIM, por ejemplo a una de Vodafone, no verás esas tres APN, verás las APN que tuvieses configuradas para esa SIM de Vodafone. Cuando vuelvas a la de Simyo, aparecerán de nuevo tus tres APN. No sé si me he explicado
PD: Es la primera vez que oigo el que una empresa use para sus empleados una APN propia, eso sí es apostar por las TIC.
Un saludo.