SuperSu es una buena alternativa. Se pueden instalar SuperSu y Superuser simultáneamente. Para alternar de uno a otro, solo hay que instalar los binarios de cada aplicación (unos sustituyen a los otros, no se si me entendéis, con lo cual solo funcionará la aplicación que tenga sus binarios instalados).
Os recomiendo que lo probéis. Yo suelo usar Superuser, sin embargo, en algunas roms he tenido que instalar supersu, porque superuser se quedaba pillado y tardaba mucho en responder.
Si ya tenéis el teléfono rooteado, lo único que tendréis que hacer es instalar supersu desde el Market, y luego abrimos la aplicación y se instalarán los binarios.
Si no nos gusta supersu, entramos en superuser y actualizamos sus binarios sin más.
