Hola, con el lector nativo no he intentado leer pdf.
Se ven mejor los libros en formato ePub, yo utilizo el programa Moon+ Reader para leer ePub y tiene un pluging con el que lee también pdf.
Como lector de epub, que es el formato que te recomiendo, aparte del lector que te dije que uso hay varios más como por ejemplo : Cool Reader, Aldiko, Mantano...
Yo los libros los meto en la externaSd en una carpeta que llamo epub.
Salu2