Se debe a que has tenido la pantalla demasiado tiempo encendida sin cambiar lo que mostraba. Es un error bastante gordo de nuestros moviles el que no podamos dejar algo estatico y acaban quemandose los pixeles.
Hay dos cosas que se me ocurren, llevarlo al SAT, o que dejes una foto con fondo liso mucho tiempo para ver si asi se "sobreescriben" esas manchas.