Como dice Alberbarrt el orden parece que SI importa, debe ser FAT32->EXT2/3->SWAP.
Sobre el "nuevo" recovery de Amon_Ra, pásate por aquí
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=67474. Desde él podrás crear automáticamente las particiones en su orden correcto, primero creas FAT32+EXT2+SWAP, y luego pasas de EXT2 a EXT3 y ya está (todo desde el recovery).
Cuidado porque formatea TODA la tarjeta, así que haz un backup de lo que tengas en FAT32 o lo perderás.
