Al hacer root e instalar recovery no afectas al sistema en nada.

Una vez que tengas el recovery instalado haz una copia nandroid y guárdala, y la podrás reinstalar cuando quieras.

Desgraciádamente el proceso de rooteo te lo deja de fábrica, por lo que tendrás que conseguir alguna utilidad que te permita hacer backup de las apps sin ser root.