como te dicen es normal que tengas que realizar dos flasheos de la rom, además es algo que viene indicado en el tutorial de instalacion o en los faq
y el tema de que la bateria.. las baterias no es recomendable dejarlas que se fundan por completo pero dices que cuando llega al 0% además hay algunas roms que no tienen implementada la funcion de carga cuando el dispostivo esta apagado..