A ver, probablemente tengas algun inconveniente en los datos que deja la bateria, que se te haya quedado en otra firm. Calibrala!!!
Toma, haz estos pasos para calibrar la bateria:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=258247
Si flashear jode las baterias, actualizar en modo oficial tambien, no tiene sentido eso tío.
No creo que sea necesario comprar nada..
Un Saludo.
PD: Es mi humilde opinion, no se mucho de baterias..