Cuando quieras meter la ROM de HTC sin modificar, lo harás con un ejecutable que te descargaras a tu PC, y lo ejecutarás desde windows. Será un RUU.exe... Eso quiere decir que con esa actualización se flasheará en tu teléfono tanto el boot, como recovery y el sistema operativo, a si que se quedaría como recien salidito de la caja.
A si que no hay problemas. En cualquier caso, y por si necesitas hacer RMA con el terminal, hazte un backup antes de liarte con todo el proceso y listo.
Salu2!