No hace falta formatear la sd si no es la fuente de tus problemas, al ponerlo de fábrica no borrará nada de la sd. Si de todas formas quieres formatear la sd, conectas el terminal al ordenador en modo almacenamiento o pones la sd en un lector de tarjetas y copias todo o solo lo que te interese, por ejemplo videos y fotos de la cámara que se encuentran en la carpeta DCIM/100media.