Quizas sea que al extraer la sd y volverlo a meter pierde la referencia. Una vez que has metido la sd, si reinicias sigue pasando?
Lo digo porque supongo que el reproductor detecta las listas al arrancar y al sacar la sd pierde la referencia, pero si arrancas de nuevo la vuelve a reconocer. Vamos, nose si es así, pero tiene su logica.