La música suena cuando estas programando la alarma??? quiero decir, la cancion o sonido se reproduce claramente????? no es un formato desconocido de mp3 u otro formato no?
Te recomiendo para alarmas a diario o que usas mucho, AlarmDroid, es un programa genial, el gestor de alarmas definitivo sin duda. De todos modos mira eso de hacer un wipe o algo asi.
Tal vez tengas algún programa restringiendo el proceso de alarmas en inicio del movil o algo asi. A mi me paso eso con el Autostarts y los sms, lo corte por la app y luego no enviaba sms el movil.
Un saludo.