Amigo ese problema es muy comun, yo lo estube intentando muchisimas veces me tomo horas lograrlo.
Los problemas que puedes tener son:
1- Tu pc tiene algun virus o error que no hace trabajar bien el minitool (me paso con una pc) o el SO.
2- Las particiones las creas arrastrando la barrita y despues moviendo la cantidad con las flechas de arriba y abajo.
Lo que a mi me soluciono el problema es borras todas las particiones y formatea en FAT 32, despues abres el programa de nuevo. Creas la primera particion como quieras pero ARRASTRANDO LA BARRITA que indica la cantidad de tu memoria (exactamente porque no puedes estarle moviendo o te dara un error)
Ya que hayas seleccionado la cantidad de MB al primer intento ya te dejara crear los demas. Sigue el mismo procedimiento. Y si te sigue marcando error sigue intenado hazta lograrlo ya sea deslizando la barrita o con las flechas que vienen abajo.
Suerte.